11.5 Gene features

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详细内容

一个 bacterial genetic unit 常见组成：

promoter，包括 transcription start site。
-35 和 -10 hex boxes，上游由 RNA polymerase 识别。
+1 transcription start。
ribosome binding site, RBS，通常位于 GOI 上游约 5-10 nt。
start codon，常为 AUG。
GOI, gene of interest/coding region。
stop codon，例如 TAA。
transcription terminator。

Transcription 发生在 promoter 开始；translation 从 RBS 定位 ribosome 后在 start codon 开始。

深入讲解

bacterial gene expression unit 把 transcription 和 translation 信号串联在同一 DNA region 中。promoter 的 -35/-10 boxes 帮助 RNA polymerase 定位，+1 是 transcription start；RBS 帮助 ribosome 在 mRNA 上定位 start codon；terminator 结束 transcription。

这些 features 对 recombinant expression 很重要。一个 GOI 只有 coding sequence 不够，还需要合适 promoter、RBS、terminator 和 vector context，才能在 host 中被正确转录和翻译。

原文小点逐条解释

原文小点： promoter，包括 transcription start site。
- 讲解： 这个小点是 gene feature 的功能模块；promoter/RBS/GOI/terminator 分别控制 transcription、translation 和 coding output。
原文小点： -35 和 -10 hex boxes，上游由 RNA polymerase 识别。
- 讲解： 这个小点是 gene feature 的功能模块；promoter/RBS/GOI/terminator 分别控制 transcription、translation 和 coding output。
原文小点： +1 transcription start。
- 讲解： 这个小点是 gene feature 的功能模块；promoter/RBS/GOI/terminator 分别控制 transcription、translation 和 coding output。
原文小点： ribosome binding site, RBS，通常位于 GOI 上游约 5-10 nt。
- 讲解： 这个小点是 gene feature 的功能模块；promoter/RBS/GOI/terminator 分别控制 transcription、translation 和 coding output。
原文小点： start codon，常为 AUG。
- 讲解： 这个小点是 gene feature 的功能模块；promoter/RBS/GOI/terminator 分别控制 transcription、translation 和 coding output。
原文小点： GOI, gene of interest/coding region。
- 讲解： 这个小点是 gene feature 的功能模块；promoter/RBS/GOI/terminator 分别控制 transcription、translation 和 coding output。
原文小点： stop codon，例如 TAA。
- 讲解： 这个小点是 gene feature 的功能模块；promoter/RBS/GOI/terminator 分别控制 transcription、translation 和 coding output。
原文小点： transcription terminator。
- 讲解： 这个小点是 gene feature 的功能模块；promoter/RBS/GOI/terminator 分别控制 transcription、translation 和 coding output。

做题和复习时怎么用

画 genetic unit 时按顺序：promoter (-35/-10, +1) -> RBS -> start codon -> GOI -> stop codon -> terminator。

常见误区

忘记 nucleic acid 和 primer 都按 5->3 方向书写。
只列工具名称，不说明每个 DNA element 或 enzyme 的功能。